在处理支付令终止后的剩余款项及后续法律问题时，需要遵循一定的法律程序和原则，以确保各方权益得到保障。以下是对这一问题的详细解答。
一、支付令终止的原因
支付令终止可能是由于以下原因：
- 债务履行完毕：债务人已经按照支付令的要求履行了债务。
- 支付令失效：支付令在规定期限内没有被债务人履行，或者支付令被法院撤销。
- 债权人撤销：债权人在支付令生效前撤销了支付令。
- 不可抗力：因不可抗力导致支付令无法执行。
二、剩余款项的处理
- 核实债务履行情况：在支付令终止后，首先要核实债务人是否已经按照支付令履行了债务。如果已经履行，则无需处理剩余款项。
- 退还多余款项：如果债务人履行了超过支付令要求的债务，债权人应退还多余的部分。
- 协商处理：如果存在争议，可以双方协商解决剩余款项的处理方式。
三、后续法律问题
- 支付令撤销后的追偿权：如果支付令被撤销，债权人可以依法向债务人追偿。
- 利息计算：在支付令终止后，如果存在利息计算问题，应根据相关法律规定计算利息。
- 诉讼时效：对于支付令终止后的追偿权，应关注诉讼时效问题，以免丧失胜诉权。
四、案例分析
案例一：支付令履行完毕
甲乙双方签订一份合同，约定甲向乙支付10万元。后因乙未收到款项，向法院申请支付令。支付令发出后，乙收到款项，但实际收到的款项为11万元。支付令终止后，乙应退还甲1万元。
案例二：支付令被撤销
甲乙双方签订一份合同，约定甲向乙支付10万元。后因乙未收到款项，向法院申请支付令。支付令发出后，甲认为支付令存在错误，向法院申请撤销。支付令被撤销后，甲有权依法向乙追偿。
五、总结
支付令终止后，正确处理剩余款项及后续法律问题至关重要。在处理过程中，要遵循法律规定，确保各方权益得到保障。如遇争议，建议寻求专业律师帮助。